More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2971 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2971  malate dehydrogenase, NAD-dependent  100 
 
 		 307 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2377  malate dehydrogenase, NAD-dependent  73.94 
 
 		 307 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.379215  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2802  malate dehydrogenase, NAD-dependent  63.4 
 
 		 311 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0687  malate dehydrogenase  58.63 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663685  normal  0.0260965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0697  malate dehydrogenase  58.31 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0654  malate dehydrogenase  58.7 
 
 		 278 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.41 
 
 		 316 aa  300  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  49.51 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  47.87 
 
 		 309 aa  298  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  47.54 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  47.49 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  44.83 
 
 		 318 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  48.52 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  46.58 
 
 		 313 aa  294  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  47.68 
 
 		 312 aa  291  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  45.71 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  44.44 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  46.89 
 
 		 308 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  47.02 
 
 		 312 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  47.02 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  47.02 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  47.02 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  47.02 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  47.02 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  47.02 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  47.02 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  47.02 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  45.25 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  46.69 
 
 		 312 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  44.34 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  44.65 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  43.81 
 
 		 317 aa  285  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  45.7 
 
 		 312 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  45.39 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  48.04 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  44.08 
 
 		 310 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  43.13 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  45.42 
 
 		 314 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.38 
 
 		 326 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  44.81 
 
 		 312 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  44.55 
 
 		 320 aa  278  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  44.88 
 
 		 320 aa  278  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  44.95 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  42.81 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.92 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.55 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  44.08 
 
 		 310 aa  275  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  45.07 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  44.22 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.41 
 
 		 333 aa  275  9e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  43 
 
 		 308 aa  275  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  42.67 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  43.45 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  43.63 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  43.63 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  43.75 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  43.41 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  45.72 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  48.34 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  43.09 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.12 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  43.31 
 
 		 316 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  44.26 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  44.55 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  43.09 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.56 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  43.23 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  44.71 
 
 		 310 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  43.61 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43 
 
 		 312 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.26 
 
 		 312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  44.55 
 
 		 320 aa  268  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  45.42 
 
 		 319 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  43.56 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.86 
 
 		 313 aa  267  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  45.78 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  41.97 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  42.77 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.52 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.52 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.52 
 
 		 320 aa  265  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.52 
 
 		 320 aa  265  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  44.92 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  44.44 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.33 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08746  malate dehydrogenase  42.33 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  41.64 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  44.41 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  42.9 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.05 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  45.78 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  43.09 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  45.78 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  42.57 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.46 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  43.41 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  44.55 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  40.97 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  40.97 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  42.44 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>