295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2927 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2927  ExsB family protein  100 
 
 
213 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2422  Queuosine synthesis-like protein  51.5 
 
 
217 aa  188  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1568  ExsB family protein  36.36 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.759596  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  31.96 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  35.05 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  38.91 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  33.33 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  33.18 
 
 
220 aa  109  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  28.96 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  33.49 
 
 
218 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  32.57 
 
 
220 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  34.98 
 
 
244 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  32.26 
 
 
221 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  29.91 
 
 
218 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  35.74 
 
 
240 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  36.04 
 
 
226 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  33.48 
 
 
225 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  38.33 
 
 
229 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  38.33 
 
 
229 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  32 
 
 
251 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  30.32 
 
 
224 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  34.86 
 
 
229 aa  104  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  37.67 
 
 
227 aa  104  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  30.88 
 
 
221 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  32.27 
 
 
251 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  33.33 
 
 
222 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  31.19 
 
 
243 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  33.64 
 
 
217 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  34.98 
 
 
232 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  35 
 
 
224 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  31.17 
 
 
229 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  33.49 
 
 
229 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  31.8 
 
 
232 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  33.03 
 
 
226 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  34.39 
 
 
224 aa  101  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  31.33 
 
 
259 aa  101  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  34.55 
 
 
224 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  34.84 
 
 
224 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  35.14 
 
 
234 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  32.44 
 
 
228 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  31.33 
 
 
285 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  33.33 
 
 
243 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  32 
 
 
232 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  35.14 
 
 
234 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  29.82 
 
 
219 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  33.03 
 
 
224 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  33.94 
 
 
230 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  36.73 
 
 
229 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  30.18 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  32.44 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  32.52 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  36.41 
 
 
226 aa  99.4  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  34.68 
 
 
227 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  33.33 
 
 
246 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  32.57 
 
 
236 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  27.91 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  28.19 
 
 
229 aa  98.2  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  32.58 
 
 
224 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  29.09 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  32.13 
 
 
224 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  28.77 
 
 
218 aa  98.2  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  30.67 
 
 
256 aa  98.2  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  32.13 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  28.05 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  30.88 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  33.91 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  33.79 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  30.59 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  30.14 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  30.9 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  33.33 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  30.56 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0093  ExsB family protein  30.74 
 
 
241 aa  96.3  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0207264  normal  0.133167 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  30.56 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  30.49 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  27.93 
 
 
231 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  30.84 
 
 
224 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  31.34 
 
 
233 aa  95.9  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  34.96 
 
 
233 aa  95.5  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  31.36 
 
 
225 aa  95.5  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  33.33 
 
 
257 aa  95.5  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  31.8 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  30.73 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  31.8 
 
 
232 aa  95.1  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  33.03 
 
 
221 aa  94.7  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  32.27 
 
 
237 aa  94  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  31.8 
 
 
232 aa  94  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  30.14 
 
 
224 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  32.87 
 
 
229 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  31.67 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  34.84 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  32.38 
 
 
484 aa  93.6  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  33.33 
 
 
229 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  33.18 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  29.68 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  32.13 
 
 
226 aa  92.8  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  37.33 
 
 
233 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  28.44 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  31.22 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  32.14 
 
 
226 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>