69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1689 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  430  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  59.24 
 
 
216 aa  227  8e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  61.03 
 
 
225 aa  222  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  62.2 
 
 
225 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  61.35 
 
 
437 aa  221  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  62.2 
 
 
225 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  62.2 
 
 
225 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  57.14 
 
 
225 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  58.6 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  57.82 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  55.77 
 
 
222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  58.06 
 
 
251 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  56.87 
 
 
221 aa  208  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  53.95 
 
 
231 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  53.49 
 
 
231 aa  207  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  60.29 
 
 
210 aa  204  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  49.31 
 
 
219 aa  204  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  59.9 
 
 
215 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  59.24 
 
 
477 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  58.14 
 
 
229 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  57.35 
 
 
441 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  54.88 
 
 
224 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  57.62 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  54.03 
 
 
209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  50.23 
 
 
219 aa  198  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  55.98 
 
 
215 aa  197  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  50.46 
 
 
223 aa  197  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  55.61 
 
 
443 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  59 
 
 
219 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  54.42 
 
 
215 aa  191  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  57.62 
 
 
459 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  53.3 
 
 
235 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  60.57 
 
 
226 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  56.04 
 
 
213 aa  187  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 
439 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  56.37 
 
 
446 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  56.94 
 
 
885 aa  185  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  56.94 
 
 
885 aa  185  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  53.05 
 
 
213 aa  185  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  53.05 
 
 
213 aa  185  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  57.08 
 
 
459 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  55.4 
 
 
227 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  55.4 
 
 
227 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  56.81 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  55.22 
 
 
884 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
406 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  52.51 
 
 
215 aa  178  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  51.92 
 
 
215 aa  178  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  52.17 
 
 
220 aa  177  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  54.5 
 
 
216 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0899  phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 
217 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 
441 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2469  dienelactone hydrolase  43.78 
 
 
239 aa  170  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  50 
 
 
224 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  51.63 
 
 
224 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  51.66 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  49.76 
 
 
223 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
468 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  36.7 
 
 
443 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  37.95 
 
 
430 aa  91.7  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2218  putative phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1968  hypothetical protein  29.91 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.200693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2337  hypothetical protein  28.07 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207577  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3438  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  31.48 
 
 
346 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.215264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  35.71 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  31.82 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0091  dienelactone hydrolase  30.65 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  26.38 
 
 
309 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1048  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.85 
 
 
316 aa  42.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>