37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0613 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 123 aa  241  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  48.78 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  47.97 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0339  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 115 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0093  hypothetical protein  39.78 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2665  DNA-binding protein  31.07 
 
 		 120 aa  50.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2159  hypothetical protein  34.69 
 
 		 198 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2228  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0102  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  35.56 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1338  helix-turn-helix domain protein  30.23 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2668  transcriptional regulator, XRE family  29.75 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2544  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal  0.0799833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2341  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2434  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2430  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.57477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2386  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.52583 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.67 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.67 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2941  helix-turn-helix domain protein  30.23 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1316  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1240  helix-turn-helix domain protein  27.61 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  32.91 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.62 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6630  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235763  hitchhiker  0.00158501 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4226  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 403 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  52.27 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 103 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>