More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2011 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  100 
 
 		 500 aa  971    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  58.93 
 
 		 489 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  58.75 
 
 		 500 aa  541  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  55.47 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  60.13 
 
 		 495 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  59.41 
 
 		 501 aa  510  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  58.35 
 
 		 492 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  52.69 
 
 		 512 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  53.01 
 
 		 516 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  57.14 
 
 		 504 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  55.35 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4164  amino acid permease-associated region  56.82 
 
 		 537 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.696427  normal  0.49431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  55.97 
 
 		 503 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  55.4 
 
 		 686 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  53.61 
 
 		 515 aa  485  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  56.62 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  57.68 
 
 		 493 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  49.52 
 
 		 520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  52.7 
 
 		 499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  50.61 
 
 		 515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  54.51 
 
 		 495 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  53.83 
 
 		 517 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1332  amino acid permease-associated region  55.56 
 
 		 490 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1368  amino acid permease-associated region  55.56 
 
 		 490 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1349  amino acid permease-associated region  55.56 
 
 		 490 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923637  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  55.19 
 
 		 521 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  51.57 
 
 		 485 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  50.2 
 
 		 476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  51.43 
 
 		 471 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1683  amino acid transporter  47.96 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  49.9 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  49.8 
 
 		 468 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  47.7 
 
 		 476 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  47.47 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  48.22 
 
 		 476 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  45.44 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  46.26 
 
 		 467 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  45.44 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  49.39 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  49.1 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 466 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  49.39 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  49.39 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  46.26 
 
 		 467 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  45.84 
 
 		 467 aa  415  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  46.46 
 
 		 467 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  46.06 
 
 		 467 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  47.22 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  49.08 
 
 		 465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  45.84 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  47.15 
 
 		 495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  44.56 
 
 		 506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  45.64 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  48.09 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  44.87 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  45.8 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  46 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  46.41 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  45.44 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  46.41 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  49.3 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  49.3 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  49.7 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  49.5 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  42.94 
 
 		 518 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  47.33 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  49.3 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  49.7 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  49.7 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  49.3 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  49.09 
 
 		 463 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  44.96 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  42.2 
 
 		 549 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  43.38 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  43.61 
 
 		 490 aa  392  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  43.23 
 
 		 486 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  45.4 
 
 		 481 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  42.39 
 
 		 483 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  43.23 
 
 		 486 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  44.4 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  47.05 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  43.26 
 
 		 496 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  43.26 
 
 		 496 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  41.73 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  41.73 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  41.73 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  41.53 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  48.78 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  41.73 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  46.49 
 
 		 497 aa  382  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  41.73 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  46.96 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  47.53 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  49.19 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  45.88 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  45.29 
 
 		 460 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  41.53 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  42.21 
 
 		 566 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>