32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1958 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  52 
 
 
234 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  54.55 
 
 
229 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  46.88 
 
 
228 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  48.11 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  32.5 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  34.78 
 
 
297 aa  85.1  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  33.16 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  30.37 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  31.46 
 
 
490 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  30.81 
 
 
494 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  30.05 
 
 
296 aa  75.5  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  30.15 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  36.6 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  29.63 
 
 
307 aa  59.3  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2424  protein of unknown function DUF105  43.53 
 
 
180 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  32.47 
 
 
385 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  27.85 
 
 
386 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  29.61 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  36.36 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  26.82 
 
 
369 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  30.41 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  32.5 
 
 
372 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  31.58 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1086  hypothetical protein  39.77 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2838  Adenosylcobinamide hydrolase  30.58 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  36.17 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  28.98 
 
 
393 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  28.21 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  31.37 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  24.77 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  30.72 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>