30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0905 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0905  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  35.27 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  27.23 
 
 		 286 aa  95.1  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  33.84 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  31.28 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  29.58 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  33.74 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  32.27 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  30.77 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  27.62 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  31.56 
 
 		 502 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  34.68 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  30.09 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  30.09 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  31.67 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  29.63 
 
 		 464 aa  69.3  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  30.54 
 
 		 427 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  29.07 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  28.3 
 
 		 471 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  28.77 
 
 		 708 aa  50.1  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  23.53 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  27.84 
 
 		 292 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  32.91 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  26.09 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  25.97 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  28.19 
 
 		 447 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  26.28 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  36 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  37.88 
 
 		 240 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  22.83 
 
 		 193 aa  42  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>