More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1453 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
187 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.26 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.26 
 
 
201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.38 
 
 
203 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.79 
 
 
202 aa  147  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  43 
 
 
199 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  41.27 
 
 
194 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.67 
 
 
193 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.72 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.74 
 
 
194 aa  143  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.68 
 
 
194 aa  141  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.3 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.21 
 
 
197 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  42.19 
 
 
194 aa  139  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.7 
 
 
199 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.93 
 
 
199 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
193 aa  137  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
200 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.7 
 
 
200 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.7 
 
 
198 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.3 
 
 
202 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.3 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.63 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.97 
 
 
197 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.88 
 
 
202 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4316  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4154  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000374115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4165  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
541 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
205 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1432  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  38.22 
 
 
199 aa  130  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000016322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.41 
 
 
197 aa  130  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
205 aa  130  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  39.69 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.31 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.54 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.61 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
205 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3138  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.9 
 
 
205 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.69 
 
 
199 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.06 
 
 
193 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.53 
 
 
195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.97 
 
 
194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.54 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.51 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.69 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.5 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.95 
 
 
190 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  38 
 
 
201 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.66 
 
 
194 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.06 
 
 
200 aa  124  9e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.38 
 
 
204 aa  124  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.06 
 
 
200 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.32 
 
 
206 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.3 
 
 
209 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.69 
 
 
199 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1631  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.04 
 
 
193 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.47 
 
 
194 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.02 
 
 
193 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.85 
 
 
200 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 
193 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.71 
 
 
195 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0389  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
200 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174867  normal  0.0250824 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 
193 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.19 
 
 
200 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.25 
 
 
192 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.69 
 
 
199 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  36.84 
 
 
212 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.24 
 
 
196 aa  121  5e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.58 
 
 
197 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.58 
 
 
197 aa  121  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.33 
 
 
201 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.24 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.34 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.34 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1231  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.98 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.34 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  37.44 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  37.44 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0005  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.63 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000354643  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.08 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.59 
 
 
213 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.44 
 
 
203 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.63 
 
 
205 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.44 
 
 
203 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.36 
 
 
194 aa  118  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.8 
 
 
211 aa  117  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.46 
 
 
207 aa  117  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.14 
 
 
207 aa  117  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.95 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>