72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1932 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  70.28 
 
 
566 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  64.06 
 
 
538 aa  712    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  66.98 
 
 
528 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  1069    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  68.53 
 
 
541 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  56.62 
 
 
507 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  53.96 
 
 
551 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  45.49 
 
 
496 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  44.47 
 
 
487 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  50.9 
 
 
484 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  45.96 
 
 
486 aa  393  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  43.49 
 
 
495 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  39.37 
 
 
588 aa  330  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  36.64 
 
 
544 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  33.13 
 
 
522 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.68 
 
 
378 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  37.33 
 
 
391 aa  238  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.06 
 
 
342 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.1 
 
 
335 aa  156  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  27.44 
 
 
600 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  27.21 
 
 
590 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  30.5 
 
 
310 aa  143  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  28.15 
 
 
663 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  27.22 
 
 
574 aa  107  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.07 
 
 
803 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  29.08 
 
 
632 aa  104  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  27.19 
 
 
607 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  29.66 
 
 
598 aa  100  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  27.51 
 
 
604 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.27 
 
 
608 aa  95.1  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  25.8 
 
 
597 aa  94  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  26.84 
 
 
817 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  26.32 
 
 
600 aa  90.5  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.92 
 
 
392 aa  86.7  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  25.15 
 
 
597 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.82 
 
 
612 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.25 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0022  hypothetical protein  23.01 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0523508  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.62 
 
 
531 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  26.63 
 
 
667 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.13 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  25.18 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  27.35 
 
 
491 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  25.96 
 
 
633 aa  60.1  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  26.78 
 
 
472 aa  60.1  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  24.53 
 
 
466 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  24.29 
 
 
592 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  26.76 
 
 
594 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  25.2 
 
 
464 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  25.57 
 
 
594 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  23.91 
 
 
634 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  26.74 
 
 
469 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  24.71 
 
 
496 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  28.12 
 
 
502 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.78 
 
 
580 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  25.7 
 
 
428 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  26.32 
 
 
880 aa  50.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  24.4 
 
 
588 aa  50.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  24.58 
 
 
428 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  23.46 
 
 
796 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  30.21 
 
 
509 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  26.84 
 
 
512 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.6 
 
 
723 aa  47.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  22.33 
 
 
428 aa  47.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  23.46 
 
 
428 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  25.27 
 
 
879 aa  47  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  26.84 
 
 
503 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.33 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  25.67 
 
 
878 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.94 
 
 
784 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  23.67 
 
 
441 aa  43.9  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  26.94 
 
 
491 aa  43.5  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>