More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0651 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0651  translation factor SUA5  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585338  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2693  translation factor SUA5  67.12 
 
 
219 aa  298  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1475  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  67.76 
 
 
217 aa  293  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4935  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  65 
 
 
219 aa  283  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398295  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3695  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.56 
 
 
217 aa  281  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2416  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.01 
 
 
217 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3738  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.03 
 
 
221 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2350  translation factor SUA5  50.44 
 
 
233 aa  232  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  43.46 
 
 
206 aa  187  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.63 
 
 
202 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2968  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.63 
 
 
202 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.14 
 
 
202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  40.19 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1595  translation factor SUA5  43.14 
 
 
203 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000829536  normal  0.144642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.14 
 
 
202 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.73 
 
 
202 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1596  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.38 
 
 
203 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.83 
 
 
207 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2168  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.83 
 
 
207 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.426518  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1398  hypothetical protein  39.71 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1598  hypothetical protein  41.15 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.73 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  39.71 
 
 
207 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.8 
 
 
221 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.8 
 
 
221 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.8 
 
 
221 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2116  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.76 
 
 
235 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.839718  normal  0.0783676 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  39.07 
 
 
207 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2120  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.2 
 
 
204 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.781433  hitchhiker  0.000757724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1688  translation factor SUA5  40.38 
 
 
231 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.84 
 
 
221 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40 
 
 
210 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  41.15 
 
 
207 aa  166  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  39.23 
 
 
209 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.23 
 
 
206 aa  165  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.23 
 
 
209 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2552  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.89 
 
 
211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000159631  normal  0.146641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.52 
 
 
205 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.44 
 
 
204 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  41.15 
 
 
206 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1876  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.96 
 
 
209 aa  164  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1581  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family translation factor  38.89 
 
 
211 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132885  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.32 
 
 
207 aa  164  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  41.15 
 
 
206 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2117  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.48 
 
 
210 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315918 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5978  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40.48 
 
 
210 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2099  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.48 
 
 
210 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1682  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.67 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.824894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2702  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.67 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.67 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  40.19 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3133  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.67 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2569  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.67 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2136  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.53 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2623  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.67 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2184  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.67 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1614  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.58 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.199609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2209  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.05 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2009  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.53 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  hitchhiker  0.000210728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1079  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.41 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0136774  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.28 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1902  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.71 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.36 
 
 
209 aa  161  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  39.23 
 
 
206 aa  161  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.09 
 
 
211 aa  161  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1038  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.23 
 
 
204 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.36 
 
 
222 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.52 
 
 
210 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.939017  hitchhiker  0.000000660923 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2009  hypothetical protein  40 
 
 
206 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15072  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0976  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.23 
 
 
204 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.76 
 
 
206 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1101  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  36.84 
 
 
207 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2310  hypothetical protein  40.95 
 
 
206 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498665  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.5 
 
 
230 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1065  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.28 
 
 
215 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0149272  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0516  translation factor SUA5  39.61 
 
 
207 aa  159  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0511  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.61 
 
 
205 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.0100809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0983  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.94 
 
 
207 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0717  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.46 
 
 
205 aa  158  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.766931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.49 
 
 
206 aa  158  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2922  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.21 
 
 
206 aa  158  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5017  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
208 aa  157  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204159  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.65 
 
 
211 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1787  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.65 
 
 
211 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  39.23 
 
 
206 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  38.76 
 
 
206 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  38.76 
 
 
206 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11213  putative Sua5/yciO/yrdC family protein  38.21 
 
 
206 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02286  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.23 
 
 
206 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.32 
 
 
206 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  37.32 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1141  hypothetical protein  35.19 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  37.32 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.01 
 
 
206 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210491  normal  0.0597402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  37.32 
 
 
206 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.32 
 
 
206 aa  154  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  37.32 
 
 
206 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  37.32 
 
 
206 aa  154  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  37.32 
 
 
206 aa  154  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>