55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4763 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
122 aa  233  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  49 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  50.94 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  44.92 
 
 
185 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  50.47 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  47.19 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  41.98 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  37.04 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  32.18 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  36.04 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  32.05 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  32.93 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  30.49 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  28.09 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  38.2 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  31.65 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  39.39 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  41.33 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  41.33 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  37.88 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  37.88 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  37.88 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  30.56 
 
 
171 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  29.33 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0911  hypothetical protein  39.58 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.559623  normal  0.647465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  35.14 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  22.58 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  28.7 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  32.91 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  30 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  30.14 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  31.82 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  44.9 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  39.29 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  32.58 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  32 
 
 
165 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  42.86 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  43.64 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  26.39 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  40.48 
 
 
323 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 
96 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>