26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0911 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0911  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  223  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.559623  normal  0.647465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  94.07 
 
 		 118 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  48.42 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  49.51 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  45.65 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  39.64 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  41.67 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  40.96 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  35.64 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  42.86 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  35.29 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  42.67 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  38.33 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  30.3 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  31.25 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  36.9 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  27.55 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  35.87 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  36.96 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  28.41 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>