More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3980 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1485  CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  67.99 
 
 		 528 aa  702    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3980  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 526 aa  1075    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  53.72 
 
 		 540 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3496  AMP-dependent synthetase and ligase  50.09 
 
 		 544 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4748  AMP-dependent synthetase and ligase  48.2 
 
 		 528 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13548  acyl-CoA synthetase  46.2 
 
 		 548 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.89294e-46  hitchhiker  0.000000367112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5215  acyl-CoA synthetase  45.97 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5009  acyl-CoA synthetase  45.49 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1543  acyl-CoA synthetase  44.53 
 
 		 549 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0888  AMP-dependent synthetase and ligase  44.88 
 
 		 545 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4627  acyl-CoA synthetase  44.74 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4715  acyl-CoA synthetase  44.74 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2248  acyl-CoA synthetase  46.63 
 
 		 550 aa  425  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  43.22 
 
 		 545 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.172383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3959  AMP-dependent synthetase and ligase  43.36 
 
 		 547 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2836  acyl-CoA synthetase  43.21 
 
 		 539 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2639  acyl-CoA synthetase  43.92 
 
 		 540 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.981359  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2725  acyl-CoA synthetase  42.72 
 
 		 548 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  43.26 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2921  acyl-CoA synthetase  41.89 
 
 		 558 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2891  acyl-CoA synthetase  41.89 
 
 		 558 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2935  acyl-CoA synthetase  41.89 
 
 		 558 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4335  acyl-CoA synthetase  40.23 
 
 		 550 aa  353  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0901424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1786  acyl-CoA synthetase  40.55 
 
 		 549 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1833  acyl-CoA synthetase  40.55 
 
 		 549 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2010  acyl-CoA synthetase  39.85 
 
 		 550 aa  346  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  37.97 
 
 		 536 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0691  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 		 553 aa  340  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  38.29 
 
 		 536 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  38.32 
 
 		 536 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1767  acyl-CoA synthetase  39.81 
 
 		 549 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.848326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1775  acyl-CoA synthetase  37.32 
 
 		 542 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1822  acyl-CoA synthetase  37.32 
 
 		 542 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1756  acyl-CoA synthetase  37.32 
 
 		 542 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 605 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1995  acyl-CoA synthetase  35.57 
 
 		 541 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4349  acyl-CoA synthetase  37.69 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1563  acyl-CoA synthetase  35.28 
 
 		 531 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1531  acyl-CoA synthetase  33.9 
 
 		 531 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 525 aa  226  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 528 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 525 aa  207  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 508 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1806  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 526 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 862 aa  197  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 520 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4502  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.12 
 
 		 564 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404  normal  0.065196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13546  fatty-acid-CoA ligase fadD18  61.74 
 
 		 218 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.46199e-133  hitchhiker  0.000000428617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  29.76 
 
 		 544 aa  191  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 530 aa  189  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.6 
 
 		 503 aa  189  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 518 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 630 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 508 aa  187  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 515 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 518 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 518 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 532 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 509 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  30.72 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 512 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.47 
 
 		 525 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 		 526 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.65 
 
 		 525 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  27.5 
 
 		 514 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 507 aa  180  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 533 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0351635  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 583 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  30.87 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.47 
 
 		 575 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.918334  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 		 565 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.87 
 
 		 526 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 		 525 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  30.42 
 
 		 516 aa  177  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  28.46 
 
 		 549 aa  176  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 509 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 551 aa  176  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 527 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 507 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.16 
 
 		 517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  31.26 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.16 
 
 		 517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.16 
 
 		 517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>