More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3030 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  79.84 
 
 
258 aa  417  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  74 
 
 
337 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  50 
 
 
252 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  45.16 
 
 
259 aa  226  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  47.41 
 
 
254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  44.94 
 
 
260 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  48.57 
 
 
251 aa  218  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  45.34 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  44.71 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  40.96 
 
 
252 aa  205  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  45.71 
 
 
257 aa  195  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  43.94 
 
 
262 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  46.03 
 
 
251 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  37.35 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  34.78 
 
 
263 aa  179  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  39.2 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 
247 aa  159  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  37.97 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  34.48 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  34.11 
 
 
276 aa  113  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
268 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  37.02 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
263 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  33.77 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.28 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  33.98 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  30.16 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  36.36 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.04 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  32.92 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.84 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.79 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  30 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.61 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  31.14 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.71 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.08 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  36.43 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.11 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  37.13 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  43.86 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  38.58 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.4 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.35 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.58 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  32.31 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3281  methyltransferase type 11  39.55 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  normal  0.615609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.55 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.29 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  30.98 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  30.43 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.31 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  30.19 
 
 
283 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.08 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.72 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  37.88 
 
 
201 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.65 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3055  methyltransferase type 11  40.3 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346509  normal  0.0118845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36.92 
 
 
312 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.15 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  31.46 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  31.44 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  28.39 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  37.21 
 
 
231 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  30.38 
 
 
231 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.35 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  33.03 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.6 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  31.13 
 
 
237 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.22 
 
 
278 aa  62.4  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  36.92 
 
 
287 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.69 
 
 
269 aa  62.4  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  39.42 
 
 
269 aa  62  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.81 
 
 
261 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.37 
 
 
268 aa  62.4  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  24.87 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35.61 
 
 
272 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.34 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  36.96 
 
 
285 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  35.66 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.54 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.86 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>