More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2643 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  100 
 
 
321 aa  607  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  57.1 
 
 
499 aa  309  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  54.03 
 
 
501 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0456  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  58.2 
 
 
499 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1570  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  56.06 
 
 
498 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.892629  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  34.89 
 
 
323 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  38.77 
 
 
348 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 
325 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 
333 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 
333 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 
333 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.31 
 
 
333 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.31 
 
 
333 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.31 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.31 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.31 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.31 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.31 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  36.2 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  36.2 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  34.46 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
924 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  28.42 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.65 
 
 
700 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4199  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
466 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
470 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
345 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  29.5 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  32.82 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
683 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  48.51 
 
 
513 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.77 
 
 
754 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  30.77 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
352 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
785 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
297 aa  60.1  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
328 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
270 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  27.92 
 
 
312 aa  59.3  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
455 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
470 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
236 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  28.95 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  34.85 
 
 
470 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
289 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  32.56 
 
 
272 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
310 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  24.04 
 
 
298 aa  56.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
340 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2359  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 
487 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000227961  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
225 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 
1523 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
1077 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
1340 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
544 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
1386 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
525 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
721 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
1523 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
353 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
359 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
477 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
753 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
1600 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
691 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1414  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 
528 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
891 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
274 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>