289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1058 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  319  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  64.47 
 
 
166 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  58.33 
 
 
205 aa  157  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  54.09 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  50.83 
 
 
196 aa  143  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  56.67 
 
 
157 aa  140  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  52.63 
 
 
175 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  47.9 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  47.13 
 
 
219 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  46.2 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  45.57 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  45.21 
 
 
179 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  45.58 
 
 
162 aa  107  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  45.81 
 
 
174 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  44.67 
 
 
178 aa  104  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  44.67 
 
 
176 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  40.94 
 
 
205 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  40.94 
 
 
222 aa  99  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  40.62 
 
 
160 aa  97.8  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  42.42 
 
 
179 aa  97.8  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  38.37 
 
 
183 aa  97.4  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  41.55 
 
 
181 aa  96.7  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  44.83 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  43.97 
 
 
190 aa  94.4  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  43.15 
 
 
192 aa  94  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  43.15 
 
 
192 aa  94  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  43.15 
 
 
192 aa  94  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  48.32 
 
 
208 aa  92  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  39.29 
 
 
177 aa  88.2  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0810  hypothetical protein  34.44 
 
 
172 aa  85.1  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0615439  hitchhiker  0.00120973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  38.75 
 
 
220 aa  84.7  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  36.62 
 
 
165 aa  84.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  42.86 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  34.96 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  57.27 
 
 
268 aa  81.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  40.19 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  44.38 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  41.14 
 
 
308 aa  80.5  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  34.21 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  32.5 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  36 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  31.79 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  35.81 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  42.7 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  34.21 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  33.1 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  40.43 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  29.14 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  41.24 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  42.42 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  35.17 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  42.39 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  37.09 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  33.99 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  32.88 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  43 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  34.04 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  34.23 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  36.3 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  34.06 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  33.56 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  38.3 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  44.55 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  38.94 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  43.01 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  40.86 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  30.3 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  38.89 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  38.39 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  41.07 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  41.35 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  38.89 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  39 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  41.07 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  34.92 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  39 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  43 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  43 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  43 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  37.08 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  37.96 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  40.86 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  40.86 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  36.28 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  31.69 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  37 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  31.79 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  38 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  39.81 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  39.42 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0606  protein of unknown function DUF150  27.27 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000662285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  37.08 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>