More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1305 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  666    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  48.51 
 
 		 326 aa  275  9e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  50 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  48.29 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0068  Alpha/beta hydrolase fold  51.9 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  48.99 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  46.06 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1493  alpha/beta hydrolase fold  44.74 
 
 		 334 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1666  alpha/beta hydrolase fold protein  43.93 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.993525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  40.21 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2844  alpha/beta hydrolase fold  41.99 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2079  alpha/beta hydrolase fold  44.2 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0269256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0017  Lysophospholipase-like protein  34.54 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.953662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  34.18 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 275 aa  94.4  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  30.89 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.14 
 
 		 277 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  26.94 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  26.94 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  26.94 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  27.63 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  24.72 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  23.77 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  23.77 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  29.78 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  19.81 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  27.05 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1660  lysophospholipase  28.32 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.631285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  30.19 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  28.26 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  22.7 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  23.32 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  27.7 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  30.26 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  28.83 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  25.39 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  27.04 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  24.68 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 559 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  22.83 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  30.15 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2699  putative hydrolase  30.04 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1860  Alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  26.95 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  22.93 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  27.27 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  22.46 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  22.64 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  20.19 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5281  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  19.73 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  21.74 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  29.32 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  22.71 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  22.19 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  27.78 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  30.83 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  21.45 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  18.3 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  21.14 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>