More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0302 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  100 
 
 
383 aa  759    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  63.9 
 
 
381 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
386 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
384 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  32.55 
 
 
382 aa  199  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
770 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  35.91 
 
 
379 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
374 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 
408 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  28.68 
 
 
383 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  38.66 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
409 aa  126  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  31.91 
 
 
388 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
376 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
390 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  40.16 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
389 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  38.87 
 
 
420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
375 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
375 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
375 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
672 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  38.91 
 
 
634 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
423 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
410 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.37 
 
 
401 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
382 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
378 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
376 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 
421 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  35.59 
 
 
420 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  33.68 
 
 
398 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
422 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  37.86 
 
 
415 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  35.12 
 
 
427 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  28.28 
 
 
770 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  27.03 
 
 
411 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
373 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 
402 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  30.75 
 
 
450 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  38.46 
 
 
466 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  32.22 
 
 
434 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
422 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
378 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
435 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
400 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  34.69 
 
 
399 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
426 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
381 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
438 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
381 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
424 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 
439 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
423 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.2 
 
 
425 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 
435 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
417 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
394 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  28.81 
 
 
380 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
377 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
419 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  32.42 
 
 
480 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  34.31 
 
 
443 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
434 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
419 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
395 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 
388 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 
482 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
382 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.61 
 
 
381 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  23.61 
 
 
381 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  23.61 
 
 
381 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  23.61 
 
 
381 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.61 
 
 
381 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  29.03 
 
 
428 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
364 aa  99.8  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
348 aa  99.8  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  21.73 
 
 
355 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.99 
 
 
418 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.61 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
430 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>