More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0896 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  100 
 
 
92 aa  186  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  63.04 
 
 
99 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  65.17 
 
 
93 aa  117  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
87 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  68.35 
 
 
95 aa  114  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  67.07 
 
 
87 aa  110  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 
85 aa  110  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 
97 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1034  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0754861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0436  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
88 aa  107  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396168  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  65.06 
 
 
85 aa  107  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
90 aa  106  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  66.67 
 
 
86 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
84 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 
98 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3945  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
88 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  65.43 
 
 
86 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  63.29 
 
 
95 aa  105  3e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  60 
 
 
94 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
85 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 
83 aa  104  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  65.43 
 
 
87 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
88 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 
83 aa  104  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
84 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2144  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 
87 aa  103  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.67084e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2390  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 
87 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0854372  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39278  Putative mitochondrial ribosomal protein L27  63.86 
 
 
133 aa  103  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.176257 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  62.03 
 
 
93 aa  103  8e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0700  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 
83 aa  103  9e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.987628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1623  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.723727  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  70.83 
 
 
94 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  68.49 
 
 
88 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  73.91 
 
 
86 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  63.86 
 
 
84 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
98 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
95 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
96 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  61.45 
 
 
84 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
89 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
88 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0803  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
89 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
88 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
88 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
85 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  65 
 
 
85 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 
85 aa  101  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11550  LSU ribosomal protein L27P  65.43 
 
 
88 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66488  normal  0.230054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
86 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 
91 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3456  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
85 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225888  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
100 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
100 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
96 aa  101  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
87 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 
85 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
94 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
94 aa  100  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  57.47 
 
 
88 aa  100  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
94 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  64.1 
 
 
100 aa  100  6e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  60.24 
 
 
85 aa  100  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
94 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  62.65 
 
 
84 aa  100  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  62.65 
 
 
83 aa  100  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
92 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
92 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  62.65 
 
 
86 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 
84 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  63.86 
 
 
92 aa  99.4  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  60 
 
 
85 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 
88 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  62.2 
 
 
94 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>