More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0436 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0436  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 88 aa  178  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1034  50S ribosomal protein L27  84.71 
 
 		 85 aa  142  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0754861  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  73.42 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  73.42 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  69.23 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 93 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0803  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  70.51 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  70.51 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  71.25 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  62.64 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  69.23 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 92 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  67.5 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  65.38 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  67.95 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  67.11 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3351  50S ribosomal protein L27  63.16 
 
 		 86 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  66.23 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  65 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  66.25 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  65.38 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  65.38 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 99 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  64.1 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  61.25 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  65.38 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  63.29 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  59.34 
 
 		 98 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  67.09 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  63.29 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  61.25 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  64.1 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  61.84 
 
 		 86 aa  100  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  64.1 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  61.84 
 
 		 86 aa  100  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  64.1 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  61.25 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  65.38 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  62.03 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  64.1 
 
 		 89 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  64.1 
 
 		 89 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  64.47 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  64.47 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  66.23 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  62.34 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  64.1 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  62.82 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  62.82 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  62.82 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  62.82 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>