More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1348 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 83 aa  167  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 83 aa  167  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1034  50S ribosomal protein L27  80.82 
 
 		 85 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0754861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  73.75 
 
 		 84 aa  120  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0436  50S ribosomal protein L27  73.42 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0809  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.115464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 90 aa  103  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  65.79 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  68.75 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  61.18 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0803  50S ribosomal protein L27  64.1 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  68.06 
 
 		 86 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  64.47 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  60 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  69.44 
 
 		 87 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>