More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0803 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0803  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1034  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0754861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0436  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 93 aa  105  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  58.89 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  64.1 
 
 		 83 aa  100  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  64.1 
 
 		 83 aa  100  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  64 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  53.33 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  64 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  64 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  56.18 
 
 		 98 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  57.53 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1749  50S ribosomal protein L27  57.75 
 
 		 83 aa  93.6  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000203988  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  54.84 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  57.78 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  61.84 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  63.01 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  54.84 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  54.84 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  56.04 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  62.16 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  63.01 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  57.3 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  61.04 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  61.04 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  53.75 
 
 		 87 aa  90.1  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  56.25 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  58.44 
 
 		 85 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  62.86 
 
 		 84 aa  89.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf327  50S ribosomal protein L27  59.46 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.871003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  58.43 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  61.64 
 
 		 100 aa  88.2  4e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  56 
 
 		 92 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  56 
 
 		 92 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  58.67 
 
 		 85 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  62.16 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  53.33 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  62.16 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  56.76 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  60.29 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  58.67 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  63.93 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  61.84 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  54.84 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  63.08 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  63.08 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  57.53 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  58.67 
 
 		 85 aa  84.3  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  51.14 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  50.55 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  58.11 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  49.45 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  52.81 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  63.08 
 
 		 85 aa  84  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  58.11 
 
 		 86 aa  83.6  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39278  Putative mitochondrial ribosomal protein L27  50.65 
 
 		 133 aa  83.6  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176257 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  57.53 
 
 		 85 aa  83.6  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  58.11 
 
 		 85 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 85 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  59.21 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  59.21 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  53.85 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  59.21 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  59.21 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  56.76 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  57.89 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  54.55 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  59.21 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  54.55 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  53.85 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  57.33 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  54.55 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  51.14 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  57.89 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0809  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.115464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>