More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_39278 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009366  OSTLU_39278  Putative mitochondrial ribosomal protein L27  100 
 
 
133 aa  272  9e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.176257 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  59.52 
 
 
93 aa  110  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 
88 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 
90 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 
88 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 
88 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  60 
 
 
85 aa  104  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 
85 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  63.86 
 
 
92 aa  103  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  64.29 
 
 
95 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  51.11 
 
 
90 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 
85 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 
90 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  51.11 
 
 
90 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  54.88 
 
 
85 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  57.47 
 
 
88 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  53.57 
 
 
92 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  53.57 
 
 
92 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  55.17 
 
 
86 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 
89 aa  100  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 
89 aa  100  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 
85 aa  100  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 
98 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  54.12 
 
 
85 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
91 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  53.57 
 
 
85 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 
87 aa  98.6  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  55.17 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  55.17 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  55.81 
 
 
85 aa  98.2  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 
85 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  61.04 
 
 
91 aa  98.2  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 
99 aa  97.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  56.98 
 
 
90 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  53.57 
 
 
85 aa  95.9  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  53.57 
 
 
85 aa  95.9  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  55.95 
 
 
86 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 
85 aa  95.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 
84 aa  95.9  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  54.02 
 
 
95 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  56.98 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 
89 aa  95.1  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  51.76 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  55.81 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  48.89 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  56.98 
 
 
90 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 
90 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  52.94 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  53.66 
 
 
85 aa  94.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  51.76 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  54.02 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  54.55 
 
 
90 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
85 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  53.68 
 
 
94 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 
89 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  56.1 
 
 
85 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 
92 aa  93.6  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 
85 aa  93.6  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  54.76 
 
 
87 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 
85 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  52.87 
 
 
89 aa  93.6  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 
86 aa  93.2  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  56.82 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  54.67 
 
 
83 aa  93.2  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  54.67 
 
 
83 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  53.57 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  55.06 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  53.01 
 
 
86 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  54.22 
 
 
85 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000765087  hitchhiker  0.00000018706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 
92 aa  92  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  54.76 
 
 
85 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  53.57 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  53.57 
 
 
87 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  54.22 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  52.38 
 
 
86 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  55.81 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  59.52 
 
 
87 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  52.38 
 
 
85 aa  92  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  52.38 
 
 
85 aa  92  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  65.71 
 
 
93 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  54.88 
 
 
82 aa  91.3  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>