More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1749 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1749  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 83 aa  167  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000203988  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  65 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  70.67 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 93 aa  103  8e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  68 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  61.25 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  61.18 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  65.33 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  56.79 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 83 aa  98.6  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  68 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  65.33 
 
 		 84 aa  97.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  54.02 
 
 		 87 aa  97.1  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 85 aa  95.9  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0841  ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82493e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  67.61 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  64 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  55.29 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  66.2 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  56.25 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  65.33 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  60 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 		 87 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 93 aa  94.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 85 aa  94.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  94.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  56.25 
 
 		 85 aa  94.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  61.25 
 
 		 86 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  64.38 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 84 aa  94.4  5e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  65.33 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  61.43 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  62.32 
 
 		 84 aa  94  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 86 aa  93.6  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0803  50S ribosomal protein L27  57.75 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  62.32 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  57.65 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  64 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2144  50S ribosomal protein L27  58.75 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.67084e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  55 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  60 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  54.22 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2390  50S ribosomal protein L27  58.75 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0854372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>