More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5259 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 95 aa  189  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1623  50S ribosomal protein L27  85.71 
 
 		 85 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.723727  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  88.89 
 
 		 85 aa  144  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3456  50S ribosomal protein L27  85.54 
 
 		 85 aa  142  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11550  LSU ribosomal protein L27P  84.52 
 
 		 88 aa  142  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66488  normal  0.230054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  87.65 
 
 		 88 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2144  50S ribosomal protein L27  86.42 
 
 		 87 aa  140  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.67084e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2390  50S ribosomal protein L27  86.42 
 
 		 87 aa  140  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0854372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  83.13 
 
 		 85 aa  139  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  81.93 
 
 		 84 aa  139  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3480  50S ribosomal protein L27  85.19 
 
 		 84 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  83.13 
 
 		 84 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  86.42 
 
 		 88 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  77.66 
 
 		 94 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  86.42 
 
 		 88 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  86.42 
 
 		 88 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3945  50S ribosomal protein L27  86.42 
 
 		 88 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1221  50S ribosomal protein L27  95.71 
 
 		 88 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.393173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  83.13 
 
 		 85 aa  137  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3859  50S ribosomal protein L27  82.72 
 
 		 84 aa  135  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.598699  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  78.57 
 
 		 84 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  80.95 
 
 		 85 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  79.76 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  81.48 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 84 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  81.48 
 
 		 86 aa  133  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  83.95 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  80.25 
 
 		 88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  76.74 
 
 		 86 aa  130  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  77.65 
 
 		 86 aa  130  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  77.11 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18260  LSU ribosomal protein L27P  79.01 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0740446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  76.19 
 
 		 85 aa  126  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0757  50S ribosomal protein L27  77.78 
 
 		 97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.819574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1474  ribosomal protein L27  82.56 
 
 		 87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.867034  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  74.7 
 
 		 85 aa  124  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 82 aa  116  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 83 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  79.71 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 92 aa  110  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  70.13 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2012  ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441981  unclonable  3.43128e-16 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  73.24 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  59.14 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  76.39 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0342  50S ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  8.5444e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2665  ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  59.78 
 
 		 93 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 87 aa  103  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  58.89 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0809  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 81 aa  101  4e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.115464  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  59.55 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  59.55 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  59.55 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  69.44 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>