227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1841 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1841  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 114 aa  226  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1803  aspartate alpha-decarboxylase  83.33 
 
 		 114 aa  177  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0880  aspartate alpha-decarboxylase  58.77 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.399475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0284  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000351643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  57.66 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  61.54 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1450  aspartate alpha-decarboxylase  64.04 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  51.82 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  51.82 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  51.82 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  51.82 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0379  aspartate alpha-decarboxylase  63.95 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0867961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  48.28 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  51.82 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0408  aspartate alpha-decarboxylase  64.37 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.293009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  52.25 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  52.29 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0412  aspartate alpha-decarboxylase  62.79 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  54.05 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  60.92 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  60.92 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1769  aspartate alpha-decarboxylase  63.95 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.25333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  46.61 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  60.92 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  60.92 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  60.92 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  60.92 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  51.72 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  47.46 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0310  aspartate alpha-decarboxylase  63.22 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  49.54 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  44.17 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  47.46 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  59.77 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  50.86 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  59.77 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  55.56 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  54.44 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  51.38 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  51.38 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2123  aspartate alpha-decarboxylase  56.63 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.244541  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  48.21 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  47.37 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  55.56 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  48.28 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  57.61 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0747  aspartate decarboxylase  45.95 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  52.22 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  47.71 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1651  aspartate alpha-decarboxylase  54 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0529  aspartate alpha-decarboxylase  54 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  46.55 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  54.44 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  54.44 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  48.72 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3067  aspartate alpha-decarboxylase  46.49 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.439202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  53.33 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0379  aspartate alpha-decarboxylase  60.92 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.172281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  53.33 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  53.33 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0566  aspartate alpha-decarboxylase  53.49 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000545672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0673  aspartate alpha-decarboxylase  47.79 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  53.33 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1864  aspartate 1-decarboxylase  47.37 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1838  aspartate 1-decarboxylase  47.37 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  54.95 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  53.33 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  58.62 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  54.95 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  54.44 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  48.67 
 
 		 134 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  56.32 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  45.69 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  54.44 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  46.85 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  47.71 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  50.45 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  44.64 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  43.48 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  51.11 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  46.55 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  47.71 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>