35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1009 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  100 
 
 		 717 aa  1461    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  97.11 
 
 		 735 aa  1433    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  29.05 
 
 		 757 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.9 
 
 		 808 aa  257  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  27.12 
 
 		 812 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  27.41 
 
 		 800 aa  225  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 		 830 aa  188  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 		 799 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 757 aa  177  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  28.2 
 
 		 838 aa  177  7e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.84 
 
 		 850 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  22.96 
 
 		 806 aa  170  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  23.82 
 
 		 808 aa  166  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.42 
 
 		 755 aa  150  9e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.52 
 
 		 780 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.13 
 
 		 737 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.67 
 
 		 845 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.29 
 
 		 731 aa  137  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 		 837 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.37 
 
 		 848 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.24 
 
 		 761 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.34 
 
 		 719 aa  111  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  22.48 
 
 		 810 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  31.94 
 
 		 750 aa  84.3  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  46.67 
 
 		 762 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1152  CRISPR-associated Csm1 family protein  22.15 
 
 		 755 aa  68.2  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00402598  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  26.55 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0316  CRISPR-associated protein, Crm2 family  32.59 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.182847  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1823  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  30.86 
 
 		 607 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0658  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.89 
 
 		 569 aa  55.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  26.87 
 
 		 488 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2297  CRISPR-associated protein, Crm2 family  25.97 
 
 		 616 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1290  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 		 914 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1194  CRISPR-associated protein, Crm2 family  31.65 
 
 		 546 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2979  CRISPR-associated protein, Crm2 family  27.08 
 
 		 623 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>