More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3845 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 802 aa  1648    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2454  glycosyl transferase group 1  41.95 
 
 		 347 aa  255  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2510  glycosyl transferase, group 1  42.07 
 
 		 345 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568348  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2752  glycosyl transferase group 1  39.54 
 
 		 346 aa  231  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1902  putative glycosyltransferase  36.1 
 
 		 348 aa  229  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.14204  normal  0.395926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0775  glycosyl transferase group 1  38.9 
 
 		 345 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0291  glycosyl transferase, group 1  38 
 
 		 345 aa  208  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.425036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0292  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 		 349 aa  173  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0527106  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  30.56 
 
 		 793 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  29.5 
 
 		 365 aa  91.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 		 365 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0750  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 		 361 aa  87.4  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366124  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 		 363 aa  87  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3590  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 		 372 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3595  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 		 372 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0979508  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3663  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 		 372 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2857  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0951854  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22554  mannosyltransferase  40.62 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  30.42 
 
 		 309 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  33.83 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0963  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  38.46 
 
 		 406 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2025  glycosyltransferase  35.8 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.872693  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  36.14 
 
 		 407 aa  73.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 415 aa  73.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 353 aa  73.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 446 aa  73.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3184  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 389 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 385 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0468  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 271 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0745455  unclonable  0.0000106435 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 		 351 aa  72  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2417  hypothetical protein  38.18 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.320398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 		 406 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 		 376 aa  70.1  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  35.5 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 		 439 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1037  putative glycosyltransferase group 1 family protein  31.48 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 495 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 419 aa  67  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 499 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 378 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 		 362 aa  66.6  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 443 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 438 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3532  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 		 389 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  34.97 
 
 		 375 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 443 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1701  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0309421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  29.79 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2700  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2980  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  34.43 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13501  glycosyl transferases group 1  33.87 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4045  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  33.54 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02448  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0107535  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4022  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 386 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 373 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 		 405 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 439 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 439 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 439 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 377 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  27.44 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 370 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 367 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 		 367 aa  63.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 405 aa  63.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0496  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 371 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166114  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  25.36 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 381 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  29.24 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3665  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>