More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2876 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  100 
 
 		 282 aa  555  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  51.94 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  49.65 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  49.47 
 
 		 292 aa  238  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  50.35 
 
 		 281 aa  235  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  43.26 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  43.26 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  46.48 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  44.33 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  33.12 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  34.54 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  32.39 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  31.83 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  31.93 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  31.58 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  32.25 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  31.96 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  32.26 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  39.53 
 
 		 522 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  30.87 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  29.93 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  30.04 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  29.54 
 
 		 320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  28.92 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  30.82 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  29.54 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  31.32 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  34.73 
 
 		 516 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  28.62 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  29.97 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  29.23 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  29.87 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  30.03 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  28.12 
 
 		 321 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  27.08 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  34.49 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  29.9 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  28.98 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  27.39 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  29.84 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  30.57 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  30.15 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  30.41 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  26.87 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  27.98 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  32.45 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  32.64 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  32.12 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  23.89 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  28.27 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  28.34 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  32.62 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  33.33 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  24.92 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  25.17 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  24.7 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  32.69 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0100  flagellin domain protein  25.54 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1452  flagellin-like  32.84 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1453  flagellin-like  33.58 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.276413  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2361  flagellin-like  30.73 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  30.61 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  31.34 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  30.61 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  30.61 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  30.61 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  30.61 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  30.61 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  30.61 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  30.61 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  31.43 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  24.46 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1477  flagellar filament core protein  24.31 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  25.63 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  28.49 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  28.77 
 
 		 389 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3956  flagellin domain-containing protein  25.59 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  28.86 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0101  flagellin domain protein  26.26 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0623  flagellin domain protein  26.19 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2998  flagellin domain protein  31.21 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055355 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2698  flagellin  27.69 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  25.9 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1004  flagellar filament core protein  29.1 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  23.89 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  28 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  32.61 
 
 		 494 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  30.37 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  28.08 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  28.08 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  25.27 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  25.18 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  24.82 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  24.1 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0102  flagellin domain protein  23.64 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  24.82 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  24.65 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  25.47 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  25.18 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  25.47 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>