41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2377 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  815    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  71.74 
 
 		 409 aa  584  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  68.06 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  59.9 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  59.64 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  55.47 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  53.11 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  53.11 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  52.85 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  50.62 
 
 		 412 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  52.99 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  50.65 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  51.05 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  51.32 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  52.59 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  53.12 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  51.05 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  50.66 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  50.91 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  51.57 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  49.1 
 
 		 397 aa  362  9e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  49.11 
 
 		 401 aa  355  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 		 385 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  43.33 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 388 aa  285  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  39.79 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 398 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  29.52 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  28.57 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  25.55 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  26.87 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>