More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1837 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  100 
 
 		 226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  56.44 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  56.44 
 
 		 225 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  59.01 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  56 
 
 		 225 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  57.78 
 
 		 251 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  53.6 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  49.06 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  44.77 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  47.44 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  40.52 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  36.05 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  37.39 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  36.82 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  33.62 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  35.19 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  37.07 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  30.9 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  37.23 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  30.34 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  39.18 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  31.6 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  33.77 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  34.42 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  34.88 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  34.88 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  34.88 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  34.19 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  34.19 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  33.92 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  32.9 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  32.47 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  35.35 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  28.05 
 
 		 252 aa  85.9  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  35.37 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  30.46 
 
 		 243 aa  85.1  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  30.58 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  25.52 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  27.55 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  26.01 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  28.96 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  32.02 
 
 		 240 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  27.84 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  27.2 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  26.15 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  28.57 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  31.97 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  33.1 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  30.08 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  26.46 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  37.88 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  27.64 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  27.74 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  25.39 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  27.66 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  30.84 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  27.05 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  30.11 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  29.48 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  31.9 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  32.62 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  24.88 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  29.79 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  28.12 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  26.11 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  29.25 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  25.37 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08975  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  29.26 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  26.32 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  30.1 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  28.72 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  23.53 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  27.61 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  28.12 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  28.37 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  27.27 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  27.12 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  30.53 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  27.1 
 
 		 507 aa  56.6  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  30.3 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  26.35 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  28.66 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  24.88 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  33.06 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  34.33 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  32.67 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  25.7 
 
 		 505 aa  55.1  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  26.9 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  32.74 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  30.41 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1094  glutamine amidotransferase class-I  27.98 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  36.88 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>