More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1711 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1711  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  533  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0371  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  78.88 
 
 		 265 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2221  putative amino acid ABC transporter  79.15 
 
 		 259 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2015  ABC transporter related  78.88 
 
 		 265 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0870  ABC transporter related  78.49 
 
 		 269 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3706  ABC transporter related  76.8 
 
 		 273 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1134  ABC transporter related  73.23 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  58.96 
 
 		 256 aa  319  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  58.27 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 257 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  58.37 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  57.75 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  56.81 
 
 		 259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  57.31 
 
 		 257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  56.54 
 
 		 257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  56.92 
 
 		 257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  57.2 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  56.81 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  58.37 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  57.6 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  56.97 
 
 		 255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 264 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  56.81 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  56.81 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4927  ABC transporter related  56.92 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000746315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  56.15 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  56.97 
 
 		 254 aa  299  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0283  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.54 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  hitchhiker  0.000143941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.77 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  56.42 
 
 		 259 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  57.43 
 
 		 285 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0301  ABC transporter related  56.54 
 
 		 257 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  0.0971272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0306  ABC transporter related  56.15 
 
 		 257 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0328197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 255 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 255 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 255 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 255 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  56.57 
 
 		 254 aa  298  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  55 
 
 		 264 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  57.14 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  57.83 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  55.25 
 
 		 259 aa  294  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  57.59 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  56.03 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  56.97 
 
 		 265 aa  292  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  57.55 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  56 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 		 264 aa  291  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 		 266 aa  291  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  56.18 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  56.18 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  55.6 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  57.14 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  57.14 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  57.79 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  57.38 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  57.14 
 
 		 266 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.52 
 
 		 263 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  57.14 
 
 		 266 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  57.14 
 
 		 266 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  53.94 
 
 		 273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  55.6 
 
 		 263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2913  ABC transporter related  60.4 
 
 		 254 aa  288  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.289619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1521  ABC transporter related  58.2 
 
 		 258 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  55.43 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1455  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0011921  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  55.42 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  53.12 
 
 		 263 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52750  arginine/ornithine transport protein AotP  58.23 
 
 		 254 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 		 254 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  54.47 
 
 		 258 aa  285  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  55.42 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  57.03 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4622  arginine/ornithine transport protein AotP  58.23 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  55.02 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1090  ABC transporter related  59.04 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455467  normal  0.0958562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6594  ABC transporter related  54.3 
 
 		 263 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147367 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5748  ABC transporter related  54.3 
 
 		 263 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6112  ABC transporter related  54.3 
 
 		 263 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3772  ABC transporter related  57.43 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446959  hitchhiker  0.00629002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3988  ABC transporter related  57.43 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5620  ABC transporter related  54.3 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33769  normal  0.48153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5837  ABC transporter related  54.3 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2375  ABC transporter, ATPase subunit  59.84 
 
 		 266 aa  278  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  54.12 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1957  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, ATP-binding component  57.14 
 
 		 256 aa  278  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4483  basic amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.03 
 
 		 254 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5103  ABC transporter related  53.91 
 
 		 263 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351754  hitchhiker  0.00435493 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003973  arginine/ornithine ABC transporter ATP-binding protein AotP  56.52 
 
 		 256 aa  278  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1432  ABC transporter related  57.03 
 
 		 254 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172857  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0176  ABC transporter related  58.43 
 
 		 257 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2925  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, ATPase subunit  55.2 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628075  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0535  ABC transporter related  56.45 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>