71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0492 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  64.36 
 
 		 202 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  64.18 
 
 		 202 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.91 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  63.69 
 
 		 157 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.52 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.39 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.3 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  43.52 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215894 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  42.49 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.93 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.36 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.24 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  43.52 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.52 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.52 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  43.52 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.01 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.01 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.52 
 
 		 206 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.01 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003796  putative cytochrome oxidase  40.98 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.81 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.93 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.26 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.31 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.82 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.75 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.26 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.51 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  30.11 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  29.57 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  40 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00437888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.03 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.95 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.31 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.53 
 
 		 410 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.51 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0295  CDP-alcohol phosphatidyl transferase  41.43 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  24.14 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  36 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.63 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.62 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.94 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.62 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1031  hypothetical protein  38.03 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.14 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0780  putative CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  40 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.57 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  29.93 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.51 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.57 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.293518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.17 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.67 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.24 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2439  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.57 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2858  phosphatidylserine synthase-like  38.67 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.48 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.48 
 
 		 211 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.94 
 
 		 200 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.94 
 
 		 200 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  34.51 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4661  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  37.11 
 
 		 275 aa  41.2  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.141457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>