More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2601 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
85 aa  176  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  63.77 
 
 
81 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  65.22 
 
 
81 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  62.32 
 
 
81 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  60.81 
 
 
97 aa  103  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  64.79 
 
 
86 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  60.87 
 
 
81 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  59.42 
 
 
81 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  62.32 
 
 
81 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  59.46 
 
 
83 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  58.82 
 
 
86 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  60.87 
 
 
81 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  62.12 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  59.42 
 
 
69 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  60 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
87 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  58.67 
 
 
99 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  57.53 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  59.7 
 
 
69 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  57.14 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  56.16 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  57.14 
 
 
81 aa  90.5  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  62.9 
 
 
104 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  57.14 
 
 
81 aa  90.5  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.56 
 
 
100 aa  90.5  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  54.93 
 
 
76 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  54.93 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  52.44 
 
 
80 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  54.29 
 
 
78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  54.29 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  54.29 
 
 
78 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  54.29 
 
 
78 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  54.29 
 
 
78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  54.29 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  54.29 
 
 
78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  54.29 
 
 
78 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  54.93 
 
 
206 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  54.29 
 
 
78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  54.29 
 
 
78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  52.17 
 
 
79 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  52.86 
 
 
82 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  54.29 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  52.63 
 
 
214 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  47.83 
 
 
93 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  51.22 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  51.22 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  53.73 
 
 
86 aa  87.8  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  63.93 
 
 
123 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  55.56 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  48.19 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  49.35 
 
 
77 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  50.7 
 
 
72 aa  87  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  59.32 
 
 
71 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  57.97 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  61.29 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 
76 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 
76 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  59.32 
 
 
71 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  56.25 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  48.57 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  52.11 
 
 
74 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  59.02 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
69 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  56.72 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  52.86 
 
 
70 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  51.43 
 
 
70 aa  84.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  56.06 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  59.02 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  51.39 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  53.73 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  52.86 
 
 
71 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  51.39 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
69 aa  84.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 
70 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  52.86 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  43.75 
 
 
107 aa  84  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  49.3 
 
 
96 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  52 
 
 
84 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  44.94 
 
 
92 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  59.7 
 
 
69 aa  83.6  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  83.6  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  59.38 
 
 
73 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  59.02 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  50.72 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  48.57 
 
 
74 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  55.74 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  54.1 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  53.03 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  53.03 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  53.03 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  50.62 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  53.03 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  55.07 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  53.62 
 
 
92 aa  82  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  52.46 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>