More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2591 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  240  5e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  48.96 
 
 		 235 aa  90.5  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  39.09 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  36.56 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  34.51 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  39.19 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  45.83 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.14 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  41.67 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  46.38 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  40.28 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  45.21 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  40.28 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  34 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  44.29 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  39.47 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  42.11 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  29.73 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  41.1 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  40.4 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40.58 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  38.03 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  37.33 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  32.63 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  37.37 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  40.28 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  42.25 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40.26 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  38.75 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1694  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107386 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  28.95 
 
 		 222 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  41.1 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  38.03 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  36.36 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  31.94 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.14 
 
 		 568 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  41.33 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  37.21 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  33.75 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  34.69 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  34.26 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  37.33 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  34.26 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  30.19 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  30.56 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  34.72 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  36.11 
 
 		 479 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  35.37 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  36.11 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.97 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  30.23 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  34.21 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  33.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  33.78 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>