More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1627 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 357 aa  734    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.88 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  42.9 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.35 
 
 		 366 aa  309  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 		 366 aa  308  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.53 
 
 		 366 aa  305  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.96 
 
 		 364 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  42.42 
 
 		 367 aa  295  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.07 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  43.18 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45 
 
 		 363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  39.83 
 
 		 365 aa  281  9e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  41.44 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.55 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  39.78 
 
 		 357 aa  278  7e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.95 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.55 
 
 		 362 aa  277  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.4 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  41.62 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.68 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  40.83 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.5 
 
 		 403 aa  272  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.4 
 
 		 360 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.98 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.16 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.61 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  41.08 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.73 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.33 
 
 		 363 aa  265  8.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.66 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.34 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  38.74 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  40.83 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.67 
 
 		 363 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.67 
 
 		 363 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.57 
 
 		 366 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  42.38 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.94 
 
 		 365 aa  256  6e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  38.06 
 
 		 370 aa  255  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  39.5 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.08 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  41.74 
 
 		 356 aa  253  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  38.33 
 
 		 371 aa  252  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.05 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  38.29 
 
 		 367 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  42.06 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.99 
 
 		 372 aa  246  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  40.62 
 
 		 363 aa  247  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.23 
 
 		 360 aa  245  8e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.95 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.23 
 
 		 360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  39.04 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  38.13 
 
 		 389 aa  242  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.27 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  37.78 
 
 		 361 aa  242  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.27 
 
 		 364 aa  242  9e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.52 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.06 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.5 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  37.39 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.87 
 
 		 369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.52 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.99 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.15 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2463  aminomethyltransferase  37.33 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  36.78 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1904  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.95 
 
 		 383 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.23 
 
 		 365 aa  230  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.13 
 
 		 379 aa  229  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.41 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.67 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00965774  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.97 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.31 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.39 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.39 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  37.23 
 
 		 372 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  34.56 
 
 		 381 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.19 
 
 		 360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1780  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.6 
 
 		 370 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.655467  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  37.36 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2307  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.38 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.15 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  32.64 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  33.51 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  35.18 
 
 		 361 aa  223  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1782  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.7 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5428  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.19 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0297013 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.7 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>