224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0853 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0853  type III secretion inner membrane protein SctT  100 
 
 
289 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.761324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  29.05 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  29.31 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  29.31 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  29.31 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1554  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  28.29 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1531  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  28.29 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1517  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.94 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0297433  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1922  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.7 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0419217  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  28.11 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  31.28 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1753  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.36 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  27.02 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2280  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  32.28 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102149  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1976  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  32.28 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2413  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  27.11 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  26.72 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0047  type III secretion apparatus protein YscT  29.47 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000121402  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  25.97 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  25.86 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  28.81 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  26.29 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  23.27 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0189  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  25.32 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  23.81 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  26.58 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  24.24 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  28.02 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003360  type III secretion protein SpaR  26.04 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  27.59 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0872  Hrp conserved HRCT transmembrane protein  22.48 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224699  hitchhiker  0.00958817 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  28.02 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  24 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  24.24 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  24.7 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  25.35 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  22.69 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  27.44 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  28.45 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  27.42 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3010  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29.91 
 
 
271 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01724  Type III secretory pathway, component EscT  25 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  25.44 
 
 
253 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5073  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  26.53 
 
 
258 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0268532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  27.51 
 
 
255 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0420  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  27.71 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  28.7 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1988  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  27.71 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1895  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  27.71 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  21.5 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0742  type III secretion inner membrane protein SctT, putative  23.99 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.588994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3812  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  29.3 
 
 
264 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3900  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29.3 
 
 
264 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.772614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3927  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  29.3 
 
 
264 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  25.53 
 
 
258 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  25.57 
 
 
261 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42640  translocation protein in type III secretion  26.54 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837601  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  24.62 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  24.62 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  24.62 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  24.66 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  26.79 
 
 
255 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0688  SctT  22.79 
 
 
531 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.833755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  25.4 
 
 
265 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2290  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  23.48 
 
 
322 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2208  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  23.48 
 
 
322 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0455  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  25.15 
 
 
284 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170011  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  26.75 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  24.26 
 
 
256 aa  58.9  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  26.75 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  26.75 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  26.75 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1639  putative type III secretion inner membrane protein SctT  23.48 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.895594  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  26.75 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  24.24 
 
 
265 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  24.24 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1944  putative type III secretion inner membrane protein SctT  23.48 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  26.75 
 
 
260 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  26.75 
 
 
260 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0624  putative type III secretion inner membrane protein SctT  23.48 
 
 
364 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  24.9 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  23.86 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  23.58 
 
 
255 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  26.49 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  25.93 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  22.83 
 
 
264 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  23.11 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  24.79 
 
 
262 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  25.28 
 
 
267 aa  56.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  26.7 
 
 
260 aa  55.8  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  22.94 
 
 
255 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  24.52 
 
 
264 aa  55.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  23.96 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  23.58 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  24.23 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>