148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0666 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0666  hypothetical protein  100 
 
 
696 aa  1436    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0578276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4023  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  30.88 
 
 
635 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.0865565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  31.18 
 
 
263 aa  66.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  31.69 
 
 
287 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  35.4 
 
 
287 aa  64.7  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  32.06 
 
 
301 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  30.81 
 
 
263 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  33.1 
 
 
283 aa  61.6  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  31.58 
 
 
284 aa  61.2  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  30.82 
 
 
289 aa  60.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  28.74 
 
 
303 aa  60.1  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  30.11 
 
 
275 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  31.21 
 
 
258 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  31.45 
 
 
294 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  29.89 
 
 
283 aa  59.7  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  34.48 
 
 
297 aa  58.9  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  33.8 
 
 
279 aa  58.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  29.03 
 
 
288 aa  57.4  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  31.72 
 
 
266 aa  57.4  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  35.71 
 
 
266 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  28.29 
 
 
285 aa  57  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  34.17 
 
 
342 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  28.23 
 
 
245 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  33.9 
 
 
304 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  32.77 
 
 
288 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  28 
 
 
292 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  35.71 
 
 
332 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  32.23 
 
 
342 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  30.16 
 
 
315 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  32.76 
 
 
287 aa  55.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  33.09 
 
 
235 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  30.16 
 
 
292 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  34.38 
 
 
267 aa  55.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  35.71 
 
 
262 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  35.71 
 
 
268 aa  55.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  31.01 
 
 
241 aa  54.7  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  34.23 
 
 
280 aa  54.7  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  32.2 
 
 
297 aa  54.7  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  33.04 
 
 
292 aa  54.3  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  30.59 
 
 
285 aa  54.3  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  33.61 
 
 
291 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  30.13 
 
 
216 aa  53.9  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  29.37 
 
 
319 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  30.46 
 
 
247 aa  53.9  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  28.57 
 
 
318 aa  53.9  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  29.37 
 
 
319 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  32.77 
 
 
301 aa  53.5  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  29.37 
 
 
319 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  33.59 
 
 
296 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  31.01 
 
 
247 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  32.9 
 
 
247 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  28.82 
 
 
273 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  30.83 
 
 
299 aa  53.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  35.71 
 
 
288 aa  53.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  28.1 
 
 
288 aa  53.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  32.21 
 
 
268 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  32.58 
 
 
278 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  30.3 
 
 
266 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  31.2 
 
 
270 aa  53.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  34.51 
 
 
245 aa  52.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  32.21 
 
 
274 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  28.65 
 
 
342 aa  52.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  32.56 
 
 
284 aa  52.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  35.14 
 
 
263 aa  52  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  32.74 
 
 
240 aa  51.6  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  32.26 
 
 
247 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  31.03 
 
 
175 aa  51.6  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  31.36 
 
 
292 aa  51.2  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  35.71 
 
 
260 aa  51.2  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  51.2  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  33.63 
 
 
266 aa  50.8  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  34.82 
 
 
245 aa  50.8  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  32.06 
 
 
268 aa  50.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  32.26 
 
 
218 aa  50.8  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  30.32 
 
 
351 aa  50.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  30.7 
 
 
282 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  28.77 
 
 
245 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  34.23 
 
 
267 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  28.77 
 
 
239 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  30.43 
 
 
282 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  27.23 
 
 
249 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  31.17 
 
 
245 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  33.93 
 
 
260 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  31.53 
 
 
229 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  31.36 
 
 
291 aa  49.7  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  30.33 
 
 
272 aa  50.1  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  30.17 
 
 
276 aa  48.9  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  29.55 
 
 
269 aa  49.3  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  32.26 
 
 
239 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  27.6 
 
 
252 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  34.19 
 
 
275 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  32.73 
 
 
217 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  30.17 
 
 
279 aa  48.9  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  30.17 
 
 
279 aa  49.3  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  33.63 
 
 
313 aa  48.9  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  30.53 
 
 
276 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  32.46 
 
 
299 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>