27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12742 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  100 
 
 		 301 aa  567  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  54.34 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  58.82 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  58.82 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  58.82 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  55.6 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  44.18 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  42.21 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  41.52 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  41.52 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  41.52 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  38.42 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  29.51 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  34.78 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  29 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  28.98 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  41.98 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  25.82 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  36.24 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  25.89 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  30.62 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  27.23 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  27.39 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  25.41 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  25.98 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  26.97 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6654  hypothetical protein  25.2 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>