28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10458 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28950  Transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 184 aa  89  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  31.98 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  26.82 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3153  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0040  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 237 aa  45.4  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  25.44 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  32.05 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 194 aa  42.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 191 aa  42  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 244 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>