36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10050 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  76.72 
 
 		 544 aa  774    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  100 
 
 		 560 aa  1117    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  75.62 
 
 		 530 aa  740    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  76.72 
 
 		 544 aa  774    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  74.21 
 
 		 561 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  76.72 
 
 		 544 aa  774    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  56.34 
 
 		 552 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  53.86 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  53.36 
 
 		 519 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  49.36 
 
 		 586 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  45.65 
 
 		 564 aa  335  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  43.8 
 
 		 498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  39.11 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  36.61 
 
 		 485 aa  249  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  34.49 
 
 		 523 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  36.24 
 
 		 485 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  36.66 
 
 		 496 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  37.06 
 
 		 475 aa  240  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  32.18 
 
 		 648 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  37.38 
 
 		 490 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  33.99 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  35.59 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  34.2 
 
 		 435 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  34.68 
 
 		 461 aa  191  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  37.09 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  33.79 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  35.78 
 
 		 629 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  32 
 
 		 470 aa  140  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  28.76 
 
 		 465 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  26.03 
 
 		 481 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  27.08 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  30.89 
 
 		 393 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  31.02 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  30.75 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 474 aa  54.7  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  36.94 
 
 		 401 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>