44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2481 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2481  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  789    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106087  hitchhiker  0.000612732 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2591  hypothetical protein  41.28 
 
 		 222 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.971625 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2484  hypothetical protein  33.07 
 
 		 230 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.371639  hitchhiker  0.00111063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  61.29 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1712  hypothetical protein  29.75 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3384  hypothetical protein  41.1 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.356218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1600  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  51.67 
 
 		 1281 aa  56.6  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1737  hypothetical protein  32.11 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  40 
 
 		 1279 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  56.92 
 
 		 830 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  43.53 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  38.54 
 
 		 268 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.47 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2643  hypothetical protein  39.62 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  52.46 
 
 		 2313 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1195  hypothetical protein  23.98 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0249722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 771 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  52.38 
 
 		 846 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  50 
 
 		 407 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1679  hypothetical protein  45.78 
 
 		 746 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.548222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  45.76 
 
 		 551 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.9 
 
 		 261 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  46.05 
 
 		 671 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  46.55 
 
 		 772 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  53.06 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  37.5 
 
 		 1217 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.76 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5165  hypothetical protein  44.44 
 
 		 570 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.83 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  55.56 
 
 		 726 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  43.01 
 
 		 487 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03300  microtubule binding protein, putative  35.79 
 
 		 694 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  46.43 
 
 		 555 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  46.03 
 
 		 778 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  50 
 
 		 522 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  33.33 
 
 		 840 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  59.18 
 
 		 338 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  66.04 
 
 		 625 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  55.26 
 
 		 431 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45586  predicted protein  50 
 
 		 706 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  51.72 
 
 		 489 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  47.92 
 
 		 253 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6484  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.85 
 
 		 1257 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>