More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1401 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 		 699 aa  1363    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  87.54 
 
 		 699 aa  1117    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  36.95 
 
 		 692 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  36.27 
 
 		 698 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  35.7 
 
 		 698 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  35.36 
 
 		 712 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 		 722 aa  341  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 		 679 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 		 689 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 		 751 aa  229  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  27.76 
 
 		 715 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  40.1 
 
 		 408 aa  218  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  31.42 
 
 		 709 aa  214  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 719 aa  214  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 		 681 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 716 aa  210  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 		 688 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 732 aa  204  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 721 aa  194  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 686 aa  193  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  32.22 
 
 		 692 aa  193  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  29.81 
 
 		 727 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  28.65 
 
 		 716 aa  182  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 		 708 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 389 aa  127  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.2 
 
 		 385 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  27.4 
 
 		 387 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  27.12 
 
 		 387 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.91 
 
 		 387 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  27.61 
 
 		 387 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.91 
 
 		 387 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  27.61 
 
 		 387 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  27.61 
 
 		 387 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.63 
 
 		 387 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  27.12 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  26.55 
 
 		 387 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  26.72 
 
 		 375 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.72 
 
 		 375 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.72 
 
 		 375 aa  108  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  26.72 
 
 		 375 aa  108  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.72 
 
 		 375 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.72 
 
 		 375 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  25.9 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  25.68 
 
 		 396 aa  102  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 		 404 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  26.72 
 
 		 375 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.72 
 
 		 375 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  26.72 
 
 		 375 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  34.05 
 
 		 674 aa  99.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  23.24 
 
 		 395 aa  97.8  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  22.42 
 
 		 756 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.41 
 
 		 386 aa  96.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  23.76 
 
 		 375 aa  95.5  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 741 aa  94  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 399 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 385 aa  92.8  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.41 
 
 		 609 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 609 aa  91.3  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  24.69 
 
 		 404 aa  90.9  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.2 
 
 		 609 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.16 
 
 		 609 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.16 
 
 		 609 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  27.16 
 
 		 609 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  27.16 
 
 		 609 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.46 
 
 		 670 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.16 
 
 		 609 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.16 
 
 		 609 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  22.89 
 
 		 747 aa  88.2  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.6 
 
 		 609 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  24.96 
 
 		 715 aa  87.8  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.11 
 
 		 671 aa  87.4  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 		 473 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 		 390 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.01 
 
 		 399 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 		 688 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.01 
 
 		 352 aa  87  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 		 665 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  24.16 
 
 		 723 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.88 
 
 		 379 aa  83.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 		 585 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  26.15 
 
 		 682 aa  82.8  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 665 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 		 664 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  29.49 
 
 		 658 aa  82  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 		 676 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  26.28 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 		 567 aa  81.6  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 666 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  27.95 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  23.08 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>