70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0141 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  100 
 
 		 333 aa  682    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  51.27 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  51.27 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  44.99 
 
 		 368 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  43.87 
 
 		 368 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  45 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  42.77 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  39.68 
 
 		 368 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  35.87 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  35.87 
 
 		 343 aa  205  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  35.24 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  35.24 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  35.24 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  34.92 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  34.92 
 
 		 343 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  36.54 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  36.21 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  36.21 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  35.22 
 
 		 351 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  39.14 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  32.51 
 
 		 354 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  32.13 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  33.04 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  34.29 
 
 		 328 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  31.99 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  33.54 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  32.61 
 
 		 374 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  36.07 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  36.07 
 
 		 358 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  30.72 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  31.68 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  31.23 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  30.48 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  27.86 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  26.91 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  25.23 
 
 		 317 aa  89.4  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  23.78 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  24.81 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  24.62 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.52 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  24.19 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  23.71 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  30.39 
 
 		 471 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  25.44 
 
 		 426 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  22.07 
 
 		 388 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  30.19 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.79 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.41 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  21.82 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  24.53 
 
 		 380 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  27.16 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  24.43 
 
 		 498 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  33.73 
 
 		 391 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  24.12 
 
 		 393 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.48 
 
 		 360 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  23.79 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  31.13 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  28.89 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  31.13 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  25.21 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  31.13 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  21.33 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  31.13 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  31.13 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  37.25 
 
 		 394 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  31.13 
 
 		 378 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.96 
 
 		 381 aa  42.7  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  25.74 
 
 		 405 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 374 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 374 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>