More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2444 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  324  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  60.12 
 
 
180 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  50.3 
 
 
187 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  46.39 
 
 
189 aa  143  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1550  hypothetical protein  45 
 
 
184 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02581  metal-dependent hydrolase  45 
 
 
184 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.682893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  48.95 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  39.47 
 
 
179 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  40.13 
 
 
179 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  36.9 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  45.78 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  40.77 
 
 
135 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  43.62 
 
 
178 aa  117  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  58.49 
 
 
174 aa  110  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  43.15 
 
 
169 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  40.41 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  40.5 
 
 
156 aa  98.2  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  43.4 
 
 
142 aa  96.3  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  49.04 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  48.6 
 
 
156 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2275  protein of unknown function UPF0054  53.04 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2326  protein of unknown function UPF0054  53.04 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.475999 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  40.54 
 
 
156 aa  87.8  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  31.58 
 
 
155 aa  87.4  8e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.23 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  48.45 
 
 
162 aa  87.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  43.81 
 
 
158 aa  87  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  46.85 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  35.1 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  43.81 
 
 
158 aa  87  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  42.11 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  38.26 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  37.75 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  34.9 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  48.31 
 
 
178 aa  84.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  34 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  45.28 
 
 
153 aa  84.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  84.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  84.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  31.72 
 
 
155 aa  84  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  40.37 
 
 
156 aa  84  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  40.37 
 
 
156 aa  84  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  40.37 
 
 
156 aa  84  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  40.37 
 
 
156 aa  84  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  40.37 
 
 
156 aa  84  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  40.37 
 
 
156 aa  84  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  44.64 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  43.52 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  41.28 
 
 
155 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  48.31 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  36.36 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  38.67 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  40 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  31.65 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  34.23 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  33.33 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  33.33 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  43.1 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  46.61 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  41.96 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  46.61 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  41.07 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  42.45 
 
 
171 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  45.16 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  46.61 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  37.5 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  41.07 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  32.62 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  37.74 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  46.23 
 
 
411 aa  81.3  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  34.03 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  39.31 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  41.9 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  45.26 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  41.07 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  41.51 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  42.06 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  41.59 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  46.59 
 
 
144 aa  79  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  41.96 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  43.1 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  39.81 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  42.5 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  41 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  36.21 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  43.24 
 
 
301 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  39.45 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  37.38 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  36.94 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  38.94 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  38.26 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  41.18 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  37.4 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  38.32 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  38.52 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  48.31 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  39.5 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  43.97 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  42.61 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>