More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1821 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  79.96 
 
 
456 aa  679    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  100 
 
 
467 aa  912    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  73.33 
 
 
447 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  75.67 
 
 
464 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  55.68 
 
 
457 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  56.26 
 
 
456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  53.91 
 
 
460 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  55.45 
 
 
456 aa  445  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  55.33 
 
 
449 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  53.28 
 
 
457 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  54.88 
 
 
459 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  53.5 
 
 
458 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  55.78 
 
 
459 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  56.82 
 
 
453 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  53.5 
 
 
458 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  53.5 
 
 
458 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  53.5 
 
 
458 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  53.5 
 
 
458 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  53.51 
 
 
459 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  51.88 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  52.12 
 
 
447 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  50.33 
 
 
464 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  51.66 
 
 
461 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  52.13 
 
 
454 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  53.51 
 
 
459 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  50.78 
 
 
449 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  46.55 
 
 
455 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  52.05 
 
 
463 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  51.36 
 
 
458 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  46.1 
 
 
455 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  46.1 
 
 
455 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  46.1 
 
 
455 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  53.78 
 
 
452 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  48.78 
 
 
464 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  45.88 
 
 
455 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.88 
 
 
455 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  46.1 
 
 
455 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  46.1 
 
 
455 aa  382  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  46.33 
 
 
455 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  46.1 
 
 
455 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  47.31 
 
 
503 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  48.75 
 
 
445 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  45.68 
 
 
456 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  49.56 
 
 
448 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  49.33 
 
 
452 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  49.33 
 
 
452 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  48.87 
 
 
453 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  48.66 
 
 
452 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  48.64 
 
 
453 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  47.05 
 
 
505 aa  363  3e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  45.95 
 
 
460 aa  363  5.0000000000000005e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  46.97 
 
 
462 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  48.65 
 
 
452 aa  361  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  48.57 
 
 
459 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  46.17 
 
 
458 aa  361  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  43.43 
 
 
460 aa  360  3e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  46.97 
 
 
462 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  45.58 
 
 
443 aa  359  5e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  48.44 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  48.21 
 
 
464 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  48.59 
 
 
435 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  48.34 
 
 
452 aa  354  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  47.94 
 
 
455 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  47.78 
 
 
452 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  47.78 
 
 
452 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  47.78 
 
 
452 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  48.44 
 
 
459 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  47.78 
 
 
452 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  47.66 
 
 
456 aa  351  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  46.44 
 
 
458 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  47.8 
 
 
468 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  45.27 
 
 
460 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  47.79 
 
 
457 aa  347  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  47.63 
 
 
448 aa  346  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  44.91 
 
 
458 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  48.39 
 
 
445 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  45.13 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  46.64 
 
 
450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  45.77 
 
 
492 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  43.27 
 
 
441 aa  333  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  43.46 
 
 
457 aa  332  7.000000000000001e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  43.46 
 
 
443 aa  332  9e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  44.61 
 
 
498 aa  332  1e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  46.29 
 
 
447 aa  331  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  47.97 
 
 
424 aa  328  8e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  43.11 
 
 
458 aa  326  4.0000000000000003e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  47.15 
 
 
456 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  44.72 
 
 
470 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  43.17 
 
 
456 aa  320  3e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  50 
 
 
471 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  44.47 
 
 
476 aa  318  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  46.17 
 
 
487 aa  313  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  48.5 
 
 
426 aa  311  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  45.27 
 
 
460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  45.21 
 
 
458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  41.34 
 
 
502 aa  303  6.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  41.85 
 
 
471 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  44.04 
 
 
443 aa  298  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  38.31 
 
 
553 aa  294  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  40.17 
 
 
494 aa  292  9e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>