More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1606 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1606  ABC transporter  100 
 
 		 258 aa  488  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0233225 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1366  ABC transporter  76.69 
 
 		 258 aa  358  7e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.895775  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29261  ABC transporter  73.54 
 
 		 258 aa  333  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19021  ABC transporter  48.79 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.49622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1032  manganese ABC transporter  47.98 
 
 		 261 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15251  ABC transporter  46.37 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11231  ABC transporter  45.14 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1040  ABC transporter  45.06 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.195913  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11311  ABC transporter  45.06 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11311  ABC transporter  45.42 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.871959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  35.12 
 
 		 285 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  34.14 
 
 		 280 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  36.97 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  34.54 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  34.48 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  37.3 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  37.3 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.71 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.98 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.64 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.64 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  32.65 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  31.51 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  27.05 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  27.31 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  32.81 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.31 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  30.59 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  30.95 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  32.34 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  29.51 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  28.81 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  25.96 
 
 		 288 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  25.96 
 
 		 288 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  25.96 
 
 		 288 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  25.96 
 
 		 288 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  27.23 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  27.76 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.43 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  29.03 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  28.4 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.43 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.43 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.43 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.43 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  29.69 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  32.11 
 
 		 290 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  27.05 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  31.58 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  30.16 
 
 		 289 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  26.56 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  25.96 
 
 		 288 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  26.56 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  26.56 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  33.16 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  31.58 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  26.64 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  28.63 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  25.11 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  29.06 
 
 		 285 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  25.11 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  28.63 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  27.76 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  28.63 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  28.63 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  28.63 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  28.63 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  31.86 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  29.47 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  27.62 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  32.29 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  26.87 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  30.69 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  29.84 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  23.4 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  24.6 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  31.6 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  27.64 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  26.83 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  25.33 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  27.09 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  26.56 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  27.66 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  27.66 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  30 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  27.2 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  28.15 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  27.2 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  27.66 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  27.66 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  27.27 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>