75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3184 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  774    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  46.35 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  42.3 
 
 		 1101 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  42.82 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  42.09 
 
 		 395 aa  279  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  40.93 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  39.95 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  41.62 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  39.9 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  38.16 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  40.62 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  35.66 
 
 		 1852 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  28.08 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  28.21 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  26.3 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  27.75 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  26.57 
 
 		 375 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  28.44 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 933 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  27.44 
 
 		 629 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  26.85 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  25.07 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  29.17 
 
 		 932 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  26.38 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  23.89 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  25.62 
 
 		 934 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  23.72 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.45 
 
 		 931 aa  90.1  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.46 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  24.65 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  21.2 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  20.8 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  27.41 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  24.93 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  27.01 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2389  GGDEF family protein  30 
 
 		 829 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  23.82 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  28.7 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  25.13 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  25.52 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  23.74 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  25.39 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  23.53 
 
 		 350 aa  57  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  24.06 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  25 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  26.61 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  26.18 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.69 
 
 		 951 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  23.65 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  26.67 
 
 		 828 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  32.75 
 
 		 464 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  25.1 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  21.28 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.21 
 
 		 947 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  25.41 
 
 		 398 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  23.16 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  23.69 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  22.16 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  24.7 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  22.98 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  23.05 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  23.93 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  22.78 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  25.82 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  28.83 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  23.36 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  29.45 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  23.11 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  22.26 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  25.32 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  23.41 
 
 		 392 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  23.41 
 
 		 392 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  23.41 
 
 		 392 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  23.41 
 
 		 392 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>