57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2343 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 376 aa  775    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  43.55 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  39.52 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  37.37 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  34.43 
 
 		 375 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  34.07 
 
 		 550 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  32.45 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  31.28 
 
 		 554 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  32.18 
 
 		 375 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  31.79 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  31.89 
 
 		 557 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  32.89 
 
 		 553 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  31.95 
 
 		 577 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  30.81 
 
 		 574 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 		 527 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.55 
 
 		 367 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.4 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  23.75 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  25.22 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  24.44 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  22.86 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  23.01 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  26.03 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  22.3 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  23.02 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  25.41 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  22.87 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  30.37 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  34.51 
 
 		 419 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  33.09 
 
 		 419 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  33.09 
 
 		 419 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  31.65 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  30.23 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54890  hypothetical protein  26.8 
 
 		 634 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285931  unclonable  1.9973799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  25.93 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  28.9 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  25.31 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  25.58 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  28.99 
 
 		 376 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  27.46 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40135  predicted protein  29.69 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  21.88 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  24.38 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  25.4 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  24.63 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  30.07 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  25.71 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  25.27 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  24.59 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  28.47 
 
 		 421 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  30.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  28.87 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  26.4 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  28.17 
 
 		 392 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  24.73 
 
 		 352 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  26.25 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.24 
 
 		 419 aa  42.7  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0383643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>