215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1175 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 408 aa  851    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  69.61 
 
 		 408 aa  636    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  69.61 
 
 		 408 aa  634    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  91.67 
 
 		 408 aa  794    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  70.1 
 
 		 408 aa  631  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  69.36 
 
 		 408 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.32 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  50.73 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.85 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  49.64 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  47.07 
 
 		 420 aa  352  8e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.33 
 
 		 412 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.33 
 
 		 412 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.34 
 
 		 416 aa  346  4e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  43.76 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  43.29 
 
 		 461 aa  342  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  43.82 
 
 		 451 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.04 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  29.81 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  35.44 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  31.68 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  35.1 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  31.94 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.7 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  33.93 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.78 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  32.78 
 
 		 361 aa  166  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.3 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.39 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  34.23 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.73 
 
 		 416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.66 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.22 
 
 		 414 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.62 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.88 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  33.63 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.18 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.89 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.17 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  28.53 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  32.34 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  32.01 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  32.01 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.43 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.36 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  32.5 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  29.83 
 
 		 370 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.42 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  32.62 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  32.3 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.3 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  30.06 
 
 		 369 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  30.09 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  30.65 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  34.99 
 
 		 407 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.13 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  31.19 
 
 		 409 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  34.42 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  32.07 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  30.75 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  29.88 
 
 		 405 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  31.1 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  31.4 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  30.84 
 
 		 448 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.28 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  27.39 
 
 		 419 aa  116  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  30.12 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  27.48 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.65 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  30.31 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  29.3 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.31 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.43 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  29.66 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.32 
 
 		 418 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.32 
 
 		 418 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  29.84 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  28.88 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  28.07 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  27.42 
 
 		 453 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.31 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  27.88 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  30.42 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  29.34 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  28.66 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  26.89 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  29.34 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  28.62 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  30.56 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  27.15 
 
 		 866 aa  106  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  28.12 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  29.04 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.77 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  30.74 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>